Durant el funcionament d'un compressor d'aire de cargol, el compliment estricte dels protocols de funcionament de l'equip és essencial per garantir la seguretat operativa i l'estabilitat de l'equip. Abans de la posada en marxa, cal verificar la font d'alimentació, la tensió, el nivell d'oli lubricant i la integritat de totes les connexions; a més, s'ha de confirmar que el sistema de refrigeració i la unitat de filtració d'aire estan en bon estat de funcionament per evitar fallades de l'equip causades per una insuficiència d'oli, bloquejos o anomalies elèctriques.
Mentre l'equip està en funcionament, els operadors han de controlar contínuament la pressió de descàrrega, la temperatura de funcionament i l'estat del motor per evitar condicions com ara sobrepressió o sobreescalfament. Els operadors no han de desmuntar arbitràriament vàlvules de seguretat, sensors de pressió o altres dispositius de protecció; a més, la sala de compressors s'ha de mantenir ben-ventilada per garantir que els entorns d'alta-temperatura no comprometin l'eficiència de dissipació de calor de l'equip. Si es detecten sorolls anormals, vibracions o fuites d'oli, la unitat s'ha d'apagar immediatament per a una inspecció per evitar que l'avaria s'escalfi.
Pel que fa al manteniment rutinari, el lubricant, els elements del filtre d'aire i els separadors d'oli-gasos s'han de substituir periòdicament per garantir la neteja interna i una lubricació eficaç. Quan s'apaga la unitat per manteniment o reparació, és imprescindible desconnectar primer la font d'alimentació i alliberar tota la pressió interna del sistema per evitar accidents de seguretat associats al treball sota pressió. A més, l'àrea que envolta l'equip s'ha de mantenir lliure de materials inflamables i explosius, i totes les tasques de manteniment i servei han de ser realitzades per professionals qualificats per millorar la seguretat operativa i allargar la vida útil del compressor d'aire de cargol.
